A díjakat Balog Zoltán, az emberi erőforrások minisztere, Gloviczki Zoltán közoktatásért felelős helyettes államtitkár és Perczel András, az Ifjúsági Bolyai Pályázat bíráló bizottságának elnöke adta át.
Világszerte elismert eredményei vannak a magyar természettudománynak, azonban hiányzik az a széles alap, azok a fiatalok, akik ezen a területen szeretnének érvényesülni, előre lépni - mondta Balog Zoltán, az emberi erőforrások minisztere köszöntő beszédében, hozzátéve: ezért különösen fontos ez a díj. Felhívta a figyelmet arra, hogy Bolyai János életművében különösen tanulságos az, hogy a tudományos eredmények mellett is teljes életet élt.
A 2012. évi pályázat témáját - Szerkezet és dinamika a molekuláris, szupramolekuláris, élő és közösségi rendszerekben - Perczel András, a Magyar Tudományos Akadémia levelező tagja, az ELTE Természettudományi Kara Szerves Kémiai tanszékének egyetemi tanára, a 2011. évi Bolyai Díj kitüntetettje határozta meg.
A bizottság döntése alapján középfokú nevelési-oktatási katergóriában az első díjat megosztva kapta Ferenc Katalin egyetemi hallgató, a budapesti Fazekas Mihály Általános Iskola és Gimnázium volt tanulója Stabilitás és dinamizmus szinapszisokban: R1N1 fehérje és a szinaptikus plaszticitás című munkájáért, valamint Nyerki Emil, a székesfehérvári Lánczos Kornél Gimnázium diákja Az erős mágneses tér növényekre gyakorolt hatásának vizsgálata című pályázatáért.
Második lett Mérő László, a szombathelyi Nyugat-magyarországi Egyetem Bolyai János Gyakorló Általános Iskola és Gimnázium tanulója az Autoasszociatív mesterséges neurális hálózatok dinamikájának összehasonlító vizsgálata című pályázatával.
Felsőoktatási kategóriában miniszteri dicséretben részesült Balassi Márton és Laki Balázs, a Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem (BME) hallgatói a Szerkezet és dinamika - Társadalmi problémák és a közös tudás modellezése ágens-alapú és mikroszimulációs keretrendszerekben című munkájukkal.
Elismerésben részesültek a diákok felkészülését segítő tanárok is, így Schlett Katalin, az ELTE egyetemi docense, Újvári Sándor, a székesfehérvári Lánczos Kornél Gimnázium tanára, Baranyai József, a szombathelyi Nyugat-magyarországi Egyetem Bolyai János Gyakorló Általános Iskola és Gimnázium tanára, valamint Meyer Dietmar, a BME tanára.